王慧元，毕业于安徽省肥东一中，1997年考入中国科学技术大学精密机械与精密仪器系，2000年中期分流至天文与应用物理系，2001年获郭沫若奖学金，同年获安徽省优秀毕业生称号，并于中国科技大学天文与应用物理系硕博连读，2005年获求是奖学金，并于2005年8月至2006年5月作为访问学生赴德国马普学会天体物理所学习，2006年获科学院院长奖学金，同年获科大理学博士学位。

王慧元2006年起攻读科大理学院博士后学位，07年3月至今担任美国马萨诸塞（Massachusetts）州立大学访问学者，其研究范围包括：活动星系核紫外偏振研究以及外流模型、活动星系核中心黑洞以及和寄主星系演化关系、宇宙大尺度结构的形成与演化、N-体宇宙学模拟以及气体动力学模拟